Marina Lazareva, dešimtokė mokinė Novosibirsko valstybinio universiteto (SESC NSU) specializuotame edukaciniame moksliniame centre, kartu su savo moksliniais vadovais sukūrė tyrimų sistemą, leidžiančią greitai aptikti grybus iš genties. Verticillium nereikalaujant brangios įrangos. Šie patogenai pažeidžia daugiau nei 200 augalų rūšių, įskaitant bulves, ir kasmet daro didelę žalą žemės ūkiui. Tradiciniai diagnostikos metodai trunka 7–14 dienų, todėl didelio masto patikra yra sudėtinga. Nors PGR analizė yra greitesnė, jai reikalinga sudėtinga ir brangi įranga. Jaunasis tyrėjas iš Novosibirsko pasiūlė alternatyvą – LAMP technologiją (kilpos tarpininkaujama izoterminė amplifikacija) – labai jautrų DNR kopijavimo metodą, veikiantį pastovioje temperatūroje. Jam nereikia terminio ciklerio, o patogeną galima aptikti per 30–60 minučių standartinėje laboratorijoje ar net lauko sąlygomis.
Pirma, studentas atliko dešimties skirtingų DNR sekų bioinformatinę analizę. Verticillium rūšis ir nustatė bendrą segmentą. Tada ji panaudojo specializuotą programinę įrangą pradmenims – trumpoms molekulėms, kurios atpažįsta ir jungiasi tik prie tikslinio patogeno DNR, – sukurti. Pagrindinis iššūkis buvo nespecifinės reakcijos, kai testas suveikė net ir švariuose mėginiuose be grybelio. Optimizuojant sąlygas – reguliuojant temperatūrą, didinant pradmenų ir magnio jonų koncentracijas ir naudojant „karšto paleidimo“ techniką – buvo pasiektas didelis specifiškumas. Dabar bandymo sistema reaguoja tik į tikslinio grybelio DNR ir sėkmingai išlaikė eksperimentinį patvirtinimą.
